1993年 原福建林学院计算机应用专业专科(森林工程系办学)、数学专业专科师资班(基础部办学)正式招生;
1995年 原福建林学院成立计算机科学系;
1996年 原福建林学院计算机及应用专业本科(计算机科学系办学)开始招生;
1998年 原福建林学院应用数学专业本科(基础部办学)开始招生;
1999年 原福建林学院计算机科学与技术、数学与应用数学专业本科开始招生;
2000年 原福建林学院电子信息工程专业本科(计算机科学系办学)开始招生;原福建农业大学和原福建林学院合并组建新的福建农林大学,原福建林学院基础部高等数学教研室、计算机科学系和原福建农业大学基础部高等数学教研室、计算机基础教研室合并组建福建农林大学计算机与信息学院;
2001年 信息与计算科学专业本科、计算机网络技术专业专科开始招生;
2002年 森林经理学(计算机应用方向)硕士专业与林学院开始联合培养招生;计算机科学与技术专业本科(专升本)、计算机应用技术专业专科开始招生;
2003年 网络系统管理、软件测试、可视化程序设计、计算机图形/图像制作专业专科开始招生;
2004年 多媒体制作、网络安全、网络构建技术、移动应用开发专业专科开始招生;
2005年 移动设备应用开发专业专科开始招生;
2006年 软件工程专业本科开始招生;
2008年 生物信息科学与技术硕士专业与生命科学学院开始联合培养招生;
2009年 网络工程专业本科开始招生;
2013年 统计学专业本科、硕士由林学院划归我院开始招生;
2017年 计算机科学与技术硕士专业开始招生;
2020年 网络空间安全专业本科开始招生;
2022年 电子信息(软件工程、网络与信息安全)专业硕士开始招生;
2024年 农林大数据科学与工程交叉学科二级博士点开始招生;计算机科学与技术(闽台合作项目)专业本科开始招生;网络工程(闽台合作项目)专业本科开始招生。